Lecture7

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1、Photoactivated localization micrograph (PALM)光激活定位显微
2、快速生长的细菌细胞可能会出现Multiple DNA replication forks多轮复制叉
3、DnaA与染色体ori结合启动染色体复制,为了严格控制染色体复制,多种调控机制就会发挥作用使DnaA-ATP失活。 其中就有一个SeqA蛋白,能够与半甲基化序列oriC紧密结合,就阻止DnaA-ATP再次启动复制。SeqA还能抑制DnaA的表达。
4、Generation time和replication time不是一个时间。
5、Par(Pratitioning)system用于在细菌细胞生长过程中将染色体和质粒平均分配给子代细胞。
6、Fts protein纤维状温度敏感蛋白,对原核生物的分裂十分重要,并且参与形成细胞分裂装置divisome。FtsZ在二分裂中起着十分重要的作用。FtsZ与真核和古菌的微管蛋白有关,分裂时形成FtsZ ring,在细胞中心(这个是由Min protein确保的),协调分裂septum隔膜形成。
7、MreB:原核生物的主要形态决定因子,shape-determine factor。 在细菌甚至古菌中形成细胞骨架;在细胞质膜下方形成spiral-shaped bands螺旋形带(coccus-shaped细菌暂时没有发现);将细胞壁合成相关物质定位到杆状细胞特定位置,是dynamic的。
8、Crescentin新月体: shape-determining protein produced by vibrio-shaped cells弧菌 of Caulobacter crescentus新月柄杆菌,新月柄杆菌这一种弧菌的形状决定因子
9、The phylogenetic position of a bacterium细菌的系统发育位置 cannot be predicted from its morphology不能从其形状预测, and vice versa
10、In cocci, cell walls grow in opposite directions outward from the FtsZ ring 在球菌中,细胞壁从FtsZ环向外以相反的方向生长。 In rod-shaped cells, growth occurs at several points along length of the cell
11、Bactoprenol细菌萜醇:运输肽聚糖前体Transport of peptidoglycan precursors
12、cell elongation——MreB,cell division——FtsZ
13、Endospores内生孢子特点: -代谢不活跃not metabolically active -可以保持休眠数年remain dormant -仍然能够对营养物质和有利条件favorable conditions做出反应 -允许萌发germination,转回营养细胞 -转回三个阶段:activation、germination、outgrowth
14、Heterocysts异形胞:圆形的增大的细胞 -细胞内是无氧环境,对氧很敏感 -用于氮固定
15、 Biofilm的形成: Attachment-Colonization-Development-Active Dispersal散布 Biofilm作用: 降低鞭毛马达flagellar motor的活性 调节细胞表面蛋白cell surface proteins(附着) 调节胞外多糖EPS的生物合成 Biofilm生态意义: 生态学意义:霍乱弧菌生物膜的形成由低细胞密度触发,高细胞密度抑制。
16、Microbial mats微生物菌席就是一种很厚的Biofilm
17、青霉素作用机理 Mechanisms: Penicillin binds to penicillin binding proteins (PBPs), preventing transpeptidation.转肽作用
18、抗生素抗性机理 Resistance Mechanisms -Lacks the target structure of the antibiotic 缺少抗生素的作用靶点 -Is impermeable to the antibiotic对抗生素是不渗透的 -Alters the antibiotic改变抗生素 -Modifies the target of the antibiotic修饰抗生素的作用靶点 -Develops a resistant pathway进化出一条抗性信号通路 -Pumps out the antibiotic泵出抗生素
19、应对antimicrobial drug resistance: Strategies -New analogs of existing antibiotics by 1) specific site modification特定位点修饰 and 2) by combinatorial chemistry类似物 -Computer drug design计算机药物设计 -Natural products天然产物 -Better usage of existing antibiotics更高效使用现在的抗生素
20、autolysins的必要性 They are enzymes that create small gaps in the cell wall at the FtsZ ring. It hydrolyzes B-1,4 glycosidic bonds of NAG and NAM in peptidoglycan. this activates the FtsZ protein to allow new peptidoglycan during synthesis.
21、antibiotics能杀细菌但不能杀病毒 Antibiotics cannot kill viruses because viruses have different structures and replicate in a different way than bacteria. Antibiotics work by targeting the growth machinery in bacteria (not viruses) to kill or inhibit those particular bacteria.
22、Why do antibiotics that target cell wall not make humans sick? 因为很多代谢途径以及关键分子,细菌细胞和人类细胞是不同的,而能够选择性抑制细菌细胞的就是抗生素。比如青霉素抑制细菌细胞壁的转肽作用,而人类细胞并没有细胞壁也没有肽聚糖,不会受影响;比如四环素能够抑制细菌70s核糖体(抑制30s小亚基),而不会对真核80s核糖体有影响。
23、MDR(multidrug resistance)多重耐药性产生机理 MDR主要的耐药机理为多药耐药基因mdr1扩增及其蛋白产物P-糖蛋白 (permeability glycoprotein, Pgp)过表达。作为一个ATP依赖性的药物转运泵,Pgp能主动将疏水性抗肿瘤药物泵出胞外, 从而减少细胞内药物蓄积, 增加药物外排。
24、Persistence和Dormancy Persisters,在基因上与对抗生素敏感的同种细胞基因型相同 抗性与休眠机制:Toxin-antitoxin(TA)module 模式 HipA原来是和HipB结合的,当Lon-PolyP比较多时,就会使HipB减少,释放free的HipA,HipA toxin会通过(p)ppGpp触发stringent response通路