1、metabolism新陈代谢:一个细胞内所有的化学反应的总和;catabolism分解代谢,energy-releasing;anabolism合成代谢,energy-requiring。
2、Nutrients营养物质:细胞生长所需的单体monomers或者前体precursors;macronutrients大量营养,required in large amounts;micronutrients微量营养,required in trace amount痕量
3、macronutrients:CHONPS、K、Mg、Ca、Na;micronutrients:Fe、Mn、B、Zn、Mo、Cu、Ni、Se、V
4、B是autoinducer信号分子for quorum sensing群体感应;Mo是硝酸盐还原、固氮酶的重要组成元素;Fe是细胞色素cytochromes、catalase过氧化氢酶、peroxidases过氧化物酶、iron-sulfur protein铁硫蛋白、oxygenases加氧酶、all nitrogenases固氮酶
5、铁获取靠的是hydroxamate group氧肟酸盐铁载体
6、nutrient的active transport:①simple transport简单转运、②group transport集团转运PEP驱动③ABC transpotterABC转运蛋白,ATP驱动(ATP-binding cassette)。
G-和G+都有ABC转运系统,G-的periplasmic binding proteins在G+叫substrate-binding proteins。
7、简单转运有同向和反向两种;group transport有特异性的和非特异性的。
8、
9、Exergonic放能的:△G<0;Endergonic吸能的:△G>0
10、Catalyst催化剂;Electron donor: the substance oxidized in a redox reaction;
Electron acceptor: the substance reduced in a redox reaction
A catalysis is usually required to breach activation energy barrier 催化需要突破活化能垒。
11、The Redox Tower:E0值越小,越倾向于做donor,在Tower中越高;越大,越倾向于做acceptor,在Tower中越低。Reduction potential (E0)还原电位
12、respiration和fermentation的区别:是否有exogenous electron acceptor外源电子受体
13、ATP synthesis的过程有:Substrate-level phosphorylation底物水平磷酸化;Oxidative phosphorylation氧化磷酸化;Photophosphorylation光合磷酸化
14、Difference between Aerobic Respiration and Anaerobic Respiration:有氧呼吸和无氧呼吸的区别:Whether oxygen is used as the exogenous electron acceptor氧气是否被用于充当外源电子受体。如果氧气充当外源电子受体,那么就是有氧呼吸。
15、呼吸过程中,电子传递路径Electron transfer Pathway是从Organic到the terminal EA终末电子受体;代谢路径Metabolic pathway是从Organic到CO2。