1、蛋白质的元素组成
CHON
凯氏定氮
2、氨基酸组成
20种L-型α氨基酸（Gly除外）
第一个发现的氨基酸：天冬氨酸；最后一个发现的氨基酸：苏氨酸
3、蛋白质分类
（1）按组成：
简单蛋白：仅由氨基酸构成
结合蛋白：核蛋白、糖蛋白、脂蛋白、金属蛋白、黄素蛋白、色素蛋白、磷蛋白
（2）按分子外形的对称程度：
球状、纤维状、膜蛋白
（3）按功能分：
酶、运输、营养和贮存、激素（蛋白激素）、受体蛋白（比如GPCR）、运动、结构、防御（抗体等）
4、蛋白质的大小和形状
- 几个氨基酸组成的肯定是肽
- 少于10kDa（80-90个氨基酸）的低分子量聚合物称为肽、寡肽或者生物活性肽
- 大于10kDa的一般称为蛋白质；但
- 氨基酸平均分子量128，蛋白质分子量=AA数目*110（相当于减掉肽键生成生成的水）
5、蛋白质分子的构象和结构层次
构象：
一级结构：
二级结构
三级结构
四级结构
6、蛋白质功能的多样性
（7）具免疫防御功能：抗体、皮肤的角蛋白（人体最大的免疫器官是皮肤）、血凝蛋白
氨基酸
基本氨基酸（编码的蛋白质氨基酸）：
稀有氨基酸（非编码的蛋白质氨基酸）：
非蛋白质氨基酸：
氨基酸的基本特性：氨基酸能聚合，有酸碱特性，有独特的理化性质
按照R基团的化学结构分类
- 非极性、脂肪族
- 芳香族
- 极性但不带电荷
- 带正电荷（碱性）
- 带负电荷（酸性）
非编码的蛋白质氨基酸
也称修饰氨基酸，是在蛋白质合成后，由基本氨基酸修饰而来；氨基酸的代谢产物
非蛋白质氨基酸
不组成蛋白质，但有生理功能
氨基酸的理化性质
（1）氨基酸的旋光性
（2）氨基酸的光吸收
Tyr、Phe、Trp含有共轭双键。
在280nm有最大光吸收
氨基酸的两性解离和酸碱滴定
氨基酸的分子内环境影响PKa
氨基酸的等电点
概念：在一定的pH条件下，某氨基酸接受或给出质子的程度相等，分子所带的静电荷为0
计算：碱性的aa是两个较大的pKa平均，其他aa都是两个较小的pKa取平均
侧链有可解离基团氨基酸的pI
氨基酸的一般物理性质
- 为无色晶体
氨基酸的化学性质
（1）α氨基参加的反应
A、与亚硝酸反应（文斯莱克法）
B、酰化反应（与酰基化试剂、
C、烷基化反应（α氨基中的氮是一个亲核中心，能发生亲核取代反应）
Sanger反应：
Edman反应：
D、生成希夫碱的反应（Schiff，与醛反应）
E、脱氨基反应
（2）α羧基参加的反应
A、成脂反应
B、成酰氯反应
C、脱羧基反应
（3）α氨基和α羧基
成肽反应
（4）侧链R基参加的反应：用于蛋白质的化学修饰
氨基酸的分离和分析
1、纸层析：利用氨基酸的亲水性，根据各种氨基酸在两个溶剂系统中具有不同的分配系数分开
- 固定相：滤纸纤维素上吸附的水
- 流动相：
2、离子交换层析：根据各种氨基酸不同的
3、高效液相色谱（HPLC）
特点：颗粒细表面积很大；高压、洗脱速度增大；快速、灵敏
多肽和蛋白质
肽由氨基酸聚合而成
肽
肽键
氨基酸顺序
氨基端（N端）和羧基端（C端）
肽的重要性质
1、旋光性
2、肽的酸碱性质
3、肽的化学反应
双缩脲反应：
常见重要的活性肽
1、谷胱甘肽（GSH，Glu-Cys-Gly）
2、催产素
3、加压素
4、胰岛素
5、脑啡肽
6、短杆菌肽（抗生素）
7、毒素
蛋白质的组成
多肽+：
辅因子
辅酶：
辅基：共价连接、一般为金属离子
复合蛋白质含有共价结构的非蛋白组分
蛋白质中氨基酸的可逆共价修饰
磷酸化：丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸
甲基化：
乙酰化：
AMP修饰：
蛋白质中氨基酸的数目
细胞色素C
蛋白质的分离纯化和研究
1、沉淀作用
大小、溶解度、疏水性、亲和纯化、热稳定性
蛋白质溶液属于胶体
水化膜
等电点沉淀：蛋白质在等电点的溶解度最小；沉淀的蛋白质保持天然构象
盐析：盐破坏蛋白质表面的水化层
盐溶
有机溶剂沉淀：
重金属离子沉淀：
加热沉淀：
2、层析
概念：
分配系数：
凝胶过滤层析（分子筛层析）：
离子交换层析：
亲和层析：
3、电泳
SDS-PAGE：
超速离心：