2.1.5 Specific Heat - box+NVT

cp ubq-nvt.conf ubq-nvt-wb.conf

structure          ../common/ubq_wb.psf
coordinates        ../common/ubq_wb.pdb
set outputname     ubq-nvt-wb
set inputname      ../1-3-box/ubq_wb_eq

# Spherical boundary conditions
sphericalBC         on
sphericalBCcenter   30.3081743413, 28.8049907121, 15.353994423
sphericalBCr1       26.0
sphericalBCk1       10
sphericalBCexp1     2

• 由于是从1-3-box中的结果继承过来，因此使用if {1}

• 在Input中，将temperature $temperature注释掉

• 不用re-specify the periodic cell，因为1-3-box中已经定义了

• 将EXECUTION SCRIPT中的Minimization注释掉。