Final

 
  • 数据收集:
    • 平移对称-衍射点-1/2/3/4/6次对称
    • whether to collect?
    • How & what to collect?
      • Oscillation angle
    • Analyze the data? 衍射点的强度/位置是由什么决定的?衍射点的弥散程度?如何让晶体长好?(simulated annealing?)
      • visual inspection
      • (auto-)indexing
      • refinement
      • integration
      • normalization
      • symmetry determination & merging
      • statistical summary & estimation, statistical formula for twinned crystals (判断是否存在twinning)
  • Twinning(双晶)
  • 分子置换法:同源结构提供phase (model bias?)
    • key: 确定分子在晶胞中的取向 (euler angle)和位置 (translation)。
    • AF? 提供rmsd小于1a的结构。药物设计。
    • 自旋转函数:kappa,晶体旋转多少角度能够与自身重合。
      • notion imagenotion image
    • 交叉旋转函数
  • 结构修正&validation
    • traditional density modification
    • SAD phasing
    • structure refinement: 使model最大限度符合observation (map)